Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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