Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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