Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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HIF1AQ16665 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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HIF1AQ16665 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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HIF1AQ16665 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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