Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GABRA6Q16445 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms