Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USF2Q15853 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USF2Q15853 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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