Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNA6Q15825 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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