Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PUM3Q15397 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PUM3Q15397 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms