Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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