Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDE1CQ14123 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
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