Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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CNGB1Q14028 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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CNGB1Q14028 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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CNGB1Q14028 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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CNGB1Q14028 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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CNGB1Q14028 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CNGB1Q14028 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CNGB1Q14028 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CNGB1Q14028 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CNGB1Q14028 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CNGB1Q14028 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CNGB1Q14028 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CNGB1Q14028 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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