Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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