Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
APOFQ13790 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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