Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TUBA3CQ13748 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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