Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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ATRQ13535 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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ATRQ13535 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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ATRQ13535 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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ATRQ13535 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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ATRQ13535 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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ATRQ13535 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRQ13535 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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ATRQ13535 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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