Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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