Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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NME3Q13232 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NME3Q13232 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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NME3Q13232 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
NME3Q13232 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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NME3Q13232 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NME3Q13232 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NME3Q13232 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NME3Q13232 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NME3Q13232 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
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NME3Q13232 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NME3Q13232 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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