Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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