Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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