Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
BPTFQ12830 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
BPTFQ12830 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms