Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXO1Q12778 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms