Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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