Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.5 ms