Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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