Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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