Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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