Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PRKD1Q15139 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRKD1Q15139 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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