Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms