Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SSPNQ14714 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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