Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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