Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SCARB2Q14108 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SCARB2Q14108 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SCARB2Q14108 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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