Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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COL9A3Q14050 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL9A3Q14050 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL9A3Q14050 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL9A3Q14050 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL9A3Q14050 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL9A3Q14050 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL9A3Q14050 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL9A3Q14050 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL9A3Q14050 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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