| RUNX2 | Q13950 | AC024022.1-202 | ENST00000508911 | 394 nt | TSL 2 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCBP2P3-201 | ENST00000509726 | 843 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC7A11-AS1-201 | ENST00000510066 | 817 nt | TSL 2 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC113385.1-201 | ENST00000511468 | 563 nt | TSL 4 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108467.1-201 | ENST00000515623 | 672 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1281P-201 | ENST00000516223 | 105 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-677P-201 | ENST00000516914 | 101 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP291-201 | ENST00000517222 | 105 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087439.1-201 | ENST00000517920 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02350-201 | ENST00000544419 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HIGD1AP1-201 | ENST00000550979 | 275 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001094.1-201 | ENST00000579805 | 193 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLGAP1-AS4-201 | ENST00000582054 | 757 nt | TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3609-201 | ENST00000582661 | 80 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC113137.1-201 | ENST00000591869 | 558 nt | TSL 4 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008946.1-201 | ENST00000599756 | 421 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022893.3-201 | ENST00000607665 | 437 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354950.2-201 | ENST00000617939 | 290 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC109471.3-201 | ENST00000625219 | 233 nt | TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006355.2-201 | ENST00000629240 | 317 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ECT2-211 | ENST00000441497 | 2825 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TUG1-202 | ENST00000521091 | 2110 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAPK10-322 | ENST00000641485 | 4530 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LIG4-205 | ENST00000614526 | 3884 nt | TSL 2 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA71.3-201 | ENST00000362582 | 128 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP119-201 | ENST00000362715 | 117 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.89-201 | ENST00000363031 | 102 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.255-201 | ENST00000364581 | 97 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR325-201 | ENST00000385260 | 98 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EI24P2-201 | ENST00000397776 | 1076 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1277-201 | ENST00000408536 | 78 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP38-201 | ENST00000410750 | 119 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP9YP27-201 | ENST00000418455 | 438 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP5-201 | ENST00000423752 | 1135 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007919.1-201 | ENST00000429380 | 217 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF124730.1-201 | ENST00000430001 | 327 nt | TSL 2 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GTF2IP20-201 | ENST00000431663 | 360 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL591212.2-201 | ENST00000433923 | 257 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512844.2-201 | ENST00000433990 | 593 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P18-201 | ENST00000448191 | 573 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092567.1-201 | ENST00000452397 | 251 nt | TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO3P38-201 | ENST00000468910 | 766 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KC877373.1-201 | ENST00000479066 | 408 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL293P-201 | ENST00000481765 | 281 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL30P14-201 | ENST00000482744 | 348 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTAPP1-201 | ENST00000489154 | 819 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SUMO2P6-201 | ENST00000505273 | 288 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO3P9-201 | ENST00000506989 | 781 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079160.1-201 | ENST00000513489 | 739 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC105417.1-201 | ENST00000514691 | 285 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.1-201 | ENST00000515993 | 133 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.5-201 | ENST00000516190 | 133 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA70.19-201 | ENST00000516717 | 90 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP503-201 | ENST00000517047 | 117 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003498.1-201 | ENST00000532530 | 347 nt | TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099793.1-201 | ENST00000567538 | 285 nt | TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005909.1-201 | ENST00000577835 | 755 nt | TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006504.3-201 | ENST00000586818 | 523 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC136601.2-201 | ENST00000604356 | 474 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC244472.2-201 | ENST00000617639 | 406 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FER-210 | ENST00000628534 | 558 nt | TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EFCAB5-213 | ENST00000638539 | 168 nt | TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYYR1-AS1-201 | ENST00000357401 | 3412 nt | TSL 2 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP9Y-201 | ENST00000338981 | 10036 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TUSC7-203 | ENST00000477539 | 2415 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354685.2-201 | ENST00000448218 | 1447 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DCUN1D1-208 | ENST00000632685 | 3147 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GABRG2-215 | ENST00000639213 | 9960 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AGL-205 | ENST00000370163 | 7166 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KCNH7-204 | ENST00000618399 | 3713 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC032011.1-201 | ENST00000611703 | 1549 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EVI2A-201 | ENST00000247270 | 1860 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPZ1-201 | ENST00000296739 | 1868 nt | APPRIS P2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SAMD3-214 | ENST00000532763 | 3690 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-552P-201 | ENST00000362869 | 119 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-451P-201 | ENST00000362921 | 107 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-512P-201 | ENST00000364438 | 103 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-217P-201 | ENST00000384164 | 104 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-903P-201 | ENST00000391270 | 109 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354719.1-201 | ENST00000406535 | 843 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA11.1-201 | ENST00000408133 | 129 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCDC126-203 | ENST00000410069 | 890 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP44-201 | ENST00000410446 | 133 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093578.1-201 | ENST00000415219 | 368 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BTF3L4P3-201 | ENST00000418879 | 476 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011243.1-201 | ENST00000420184 | 415 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02263-203 | ENST00000426240 | 515 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL033504.1-201 | ENST00000427015 | 773 nt | TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPS10P2-201 | ENST00000431226 | 381 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139415.2-201 | ENST00000431968 | 163 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL596276.1-201 | ENST00000434465 | 418 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC078845.1-202 | ENST00000435996 | 733 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136972.1-201 | ENST00000443471 | 351 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FABP5P13-201 | ENST00000452144 | 328 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTUS2-AS2-203 | ENST00000452602 | 651 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FABP5P15-201 | ENST00000453566 | 214 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DCLRE1CP1-201 | ENST00000454630 | 470 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL160162.1-201 | ENST00000456715 | 442 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL024497.2-201 | ENST00000457081 | 317 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-953P-201 | ENST00000459154 | 107 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |