Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SPTAN1Q13813 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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