Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
APOFQ13790 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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APOFQ13790 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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