Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms