Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRQ13535 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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