Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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