Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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