Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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CLN3Q13286 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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CLN3Q13286 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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