Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CHAF1BQ13112 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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CHAF1BQ13112 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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