Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRDNQ13061 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms