Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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