Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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BNIP1Q12981 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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BNIP1Q12981 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
BNIP1Q12981 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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BNIP1Q12981 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP1Q12981 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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BNIP1Q12981 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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BNIP1Q12981 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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BNIP1Q12981 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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BNIP1Q12981 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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