Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STX4Q12846 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
STX4Q12846 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
STX4Q12846 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
STX4Q12846 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms