Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms