Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms