Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRM3Q9NNZ6 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms