Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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ZBED3Q96IU2 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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ZBED3Q96IU2 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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ZBED3Q96IU2 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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ZBED3Q96IU2 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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ZBED3Q96IU2 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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