Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms