Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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ZNF548Q8NEK5 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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ZNF548Q8NEK5 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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ZNF548Q8NEK5 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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ZNF548Q8NEK5 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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ZNF548Q8NEK5 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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